In Gunpoint kruipt de speler in de huid van een freelance spion die er op uit wordt gestuurd om verschillende computerbestanden te stelen of te wissen. Om dit te doen moet de spion inbreken in bedrijfspanden die vol zitten met bewakers.
Door gebruik te maken van handige gadgets, zoals een apparaat dat elektriciteitscircuits omwisselt, schakel je op slinkse wijze de bewakers uit. Je kunt de bewakers knock-out slaan met een deur, ze simpelweg buitensluiten of ze door een raam slingeren.

